המכון למחקר החי פועל תחת עקרונות ברורים של צמצום הפגיעה והסבל של החיה למינימום ההכרחי. פעילות המכון נעשית בכפוף לחוק צער בעלי חיים , אמנת NRI ואישורי המועצה לניסויים בבעלי חיים בישראל.

טרם העברת כל ניסוי לאישור המועצה, מסייע צוות המכון בייעוץ ובניית פרוטוקול הניסוי. זאת על סמך ניסיון רב-שנים בטיפול בחזירים, במהלכן רכש הצוות היכרות עם אורח חייהם והמאפיינים ההתנהגותיים שלהם.

הודות לכך באפשרות אנשי המכון לספק לחוקרים מידע רב-ערך, שיסייע להגיע לביצוע יעיל, מדוייק וידידותי לחיה ככל האפשר, למשל: בחירת חית המודל, צורת העבודה, שיטות הבדיקה ותדירותן, השיטה ללקיחת דם וכן הלאה. התאמת שיטת הביצוע למאפייני החיה מסייעת גם במניעת השפעות פיזיולוגיות נלוות כתוצאה מאכף (STRESS), שעלולה להיות להן השלכה על תוצאות הניסוי.

המכון נושא תקן IQNET ופועל על פי תקן מאושר ISO9001